MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli BL21(DE3) chromosome

Total Repeats: 80792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012971	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286928
2	NC_012971	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286928
3	NC_012971	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
4	NC_012971	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	254286929
5	NC_012971	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	254286929
6	NC_012971	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	254286929
7	NC_012971	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
8	NC_012971	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
9	NC_012971	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	254286929
10	NC_012971	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286929
11	NC_012971	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
12	NC_012971	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
13	NC_012971	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	254286929
14	NC_012971	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	254286929
15	NC_012971	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
16	NC_012971	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286929
17	NC_012971	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286929
18	NC_012971	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
19	NC_012971	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
20	NC_012971	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
21	NC_012971	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	254286929
22	NC_012971	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
23	NC_012971	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	254286929
24	NC_012971	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
25	NC_012971	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286929
26	NC_012971	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
27	NC_012971	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254286929
28	NC_012971	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
29	NC_012971	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	254286929
30	NC_012971	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
31	NC_012971	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
32	NC_012971	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	254286929
33	NC_012971	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286929
34	NC_012971	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
35	NC_012971	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286929
36	NC_012971	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
37	NC_012971	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
38	NC_012971	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
39	NC_012971	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286929
40	NC_012971	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	254286929
41	NC_012971	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286929
42	NC_012971	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
43	NC_012971	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
44	NC_012971	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	254286929
45	NC_012971	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286929
46	NC_012971	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
47	NC_012971	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
48	NC_012971	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
49	NC_012971	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
50	NC_012971	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
51	NC_012971	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
52	NC_012971	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
53	NC_012971	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254286929
54	NC_012971	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
55	NC_012971	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286929
56	NC_012971	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	254286929
57	NC_012971	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
58	NC_012971	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
59	NC_012971	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	254286929
60	NC_012971	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254286929
61	NC_012971	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
62	NC_012971	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286930
63	NC_012971	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286930
64	NC_012971	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286930
65	NC_012971	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	254286930
66	NC_012971	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286930
67	NC_012971	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	254286930
68	NC_012971	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286930
69	NC_012971	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286930
70	NC_012971	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286930
71	NC_012971	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286930
72	NC_012971	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286930
73	NC_012971	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	254286930
74	NC_012971	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286930
75	NC_012971	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286930
76	NC_012971	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	254286930
77	NC_012971	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	254286930
78	NC_012971	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	254286930
79	NC_012971	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286930
80	NC_012971	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	254286930
81	NC_012971	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254286930
82	NC_012971	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	254286930
83	NC_012971	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286930
84	NC_012971	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	254286931
85	NC_012971	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	254286931
86	NC_012971	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
87	NC_012971	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
88	NC_012971	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	254286931
89	NC_012971	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286931
90	NC_012971	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286931
91	NC_012971	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
92	NC_012971	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286931
93	NC_012971	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	254286931
94	NC_012971	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286931
95	NC_012971	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286931
96	NC_012971	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286931
97	NC_012971	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286931
98	NC_012971	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286931
99	NC_012971	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286931
100	NC_012971	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286931
101	NC_012971	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
102	NC_012971	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	254286931
103	NC_012971	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286931
104	NC_012971	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286931
105	NC_012971	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
106	NC_012971	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286931
107	NC_012971	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286932
108	NC_012971	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286932
109	NC_012971	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286932
110	NC_012971	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286932
111	NC_012971	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286932
112	NC_012971	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286932
113	NC_012971	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254286932
114	NC_012971	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286932
115	NC_012971	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286932
116	NC_012971	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286933
117	NC_012971	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254286933
118	NC_012971	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286933
119	NC_012971	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286933
120	NC_012971	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	254286933
121	NC_012971	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254286933
122	NC_012971	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286933
123	NC_012971	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286933
124	NC_012971	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286933
125	NC_012971	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286933
126	NC_012971	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286933
127	NC_012971	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286933
128	NC_012971	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286933
129	NC_012971	AAATCG	2	12	6150	6161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254286933
130	NC_012971	AGCG	2	8	6268	6275	25 %	0 %	50 %	25 %	254286933
131	NC_012971	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286933
132	NC_012971	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286933
133	NC_012971	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286934
134	NC_012971	GGC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286934
135	NC_012971	GCC	2	6	6758	6763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286934
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138	NC_012971	ATC	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286934
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141	NC_012971	CGC	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286934
142	NC_012971	GCC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286934
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150	NC_012971	CAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286934
151	NC_012971	TAA	2	6	7933	7938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254286934
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153	NC_012971	GCAT	2	8	7954	7961	25 %	25 %	25 %	25 %	254286934
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156	NC_012971	TC	3	6	8344	8349	0 %	50 %	0 %	50 %	254286935
157	NC_012971	CGCAG	2	10	8358	8367	20 %	0 %	40 %	40 %	254286935
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161	NC_012971	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286935
162	NC_012971	CGAC	2	8	8453	8460	25 %	0 %	25 %	50 %	254286935
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168	NC_012971	AGA	2	6	8829	8834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286935
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174	NC_012971	CTG	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286935
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260	NC_012971	GAA	2	6	13811	13816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286939
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